1985年原湖南醫(yī)科大學與國家醫(yī)藥管理總局聯(lián)合試辦五年制藥學專業(yè)，1996年籌建藥學系，1997年面向全國招生，學制四年，授予理學學士學位。藥學一級學科為湖南省一級重點學科，具有藥學一級學科碩、博士學位授予權(quán)，2011年新增生物與醫(yī)藥工程博士學位授予權(quán)；藥學專業(yè)為湖南省重點專業(yè)和特色專業(yè)。

學院本科生專業(yè)以大藥學教育為基礎，采用“前期趨同，后期分化，個性發(fā)展”的培養(yǎng)模式。以培養(yǎng)學生的創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)精神為核心，注重基本技能和實際工作能力的培養(yǎng)。學院構(gòu)建了較為完善的生物功能表征、小分子藥物發(fā)現(xiàn)、設計與合成、新型藥物傳遞系統(tǒng)設計與制備、藥物質(zhì)量控制與藥物代謝研究的教學科研體系，為高素質(zhì)的藥學專業(yè)人才培養(yǎng)提供了強力支撐。